Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms