Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FosbP13346 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FosbP13346 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FosbP13346 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FosbP13346 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FosbP13346 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FosbP13346 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FosbP13346 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FosbP13346 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FosbP13346 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FosbP13346 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FosbP13346 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FosbP13346 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FosbP13346 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FosbP13346 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FosbP13346 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FosbP13346 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FosbP13346 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FosbP13346 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FosbP13346 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FosbP13346 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FosbP13346 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FosbP13346 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FosbP13346 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FosbP13346 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FosbP13346 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FosbP13346 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FosbP13346 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FosbP13346 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FosbP13346 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FosbP13346 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FosbP13346 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FosbP13346 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FosbP13346 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FosbP13346 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FosbP13346 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FosbP13346 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FosbP13346 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FosbP13346 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FosbP13346 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FosbP13346 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FosbP13346 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FosbP13346 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FosbP13346 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FosbP13346 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FosbP13346 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FosbP13346 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FosbP13346 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FosbP13346 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FosbP13346 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FosbP13346 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FosbP13346 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FosbP13346 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FosbP13346 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FosbP13346 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FosbP13346 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FosbP13346 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FosbP13346 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FosbP13346 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FosbP13346 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FosbP13346 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FosbP13346 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FosbP13346 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FosbP13346 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FosbP13346 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FosbP13346 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FosbP13346 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FosbP13346 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms