Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nr4a1P12813 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nr4a1P12813 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms