Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb1P12658 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Calb1P12658 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb1P12658 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb1P12658 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb1P12658 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb1P12658 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calb1P12658 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms