Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
OtcP11725 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OtcP11725 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OtcP11725 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OtcP11725 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OtcP11725 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OtcP11725 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OtcP11725 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OtcP11725 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OtcP11725 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtcP11725 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtcP11725 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtcP11725 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtcP11725 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtcP11725 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtcP11725 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtcP11725 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtcP11725 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtcP11725 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtcP11725 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtcP11725 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtcP11725 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtcP11725 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OtcP11725 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OtcP11725 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms