Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itga5P11688 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga5P11688 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms