Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolP11369 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolP11369 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolP11369 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolP11369 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PolP11369 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolP11369 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PolP11369 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolP11369 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolP11369 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolP11369 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolP11369 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PolP11369 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolP11369 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolP11369 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PolP11369 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolP11369 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolP11369 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolP11369 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolP11369 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PolP11369 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PolP11369 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PolP11369 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP11369 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP11369 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP11369 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP11369 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP11369 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP11369 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP11369 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP11369 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP11369 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP11369 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP11369 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP11369 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP11369 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP11369 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PolP11369 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PolP11369 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PolP11369 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms