Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd4P10628 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms