Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nid1P10493 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nid1P10493 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nid1P10493 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nid1P10493 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms