Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms