Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms