Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa6P09092 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa6P09092 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa6P09092 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa6P09092 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa6P09092 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa6P09092 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa6P09092 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms