Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb1P09055 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms