Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Prm2P07978 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms