Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtrP07309 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TtrP07309 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtrP07309 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtrP07309 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
TtrP07309 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtrP07309 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtrP07309 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtrP07309 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtrP07309 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtrP07309 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtrP07309 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TtrP07309 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TtrP07309 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TtrP07309 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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TtrP07309 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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TtrP07309 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtrP07309 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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TtrP07309 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtrP07309 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtrP07309 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtrP07309 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtrP07309 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtrP07309 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtrP07309 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtrP07309 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TtrP07309 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TtrP07309 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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