Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01746 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01746 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01746 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01746 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01746 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01746 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01746 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01746 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01746 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01746 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01746 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01746 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01746 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms