Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01679 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01679 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01679 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01679 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01679 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01679 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01679 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01679 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01679 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01679 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01679 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01679 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
P01679 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01679 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01679 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01679 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01679 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01679 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01679 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01679 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01679 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01679 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01679 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01679 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01679 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01679 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01679 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01679 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01679 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01679 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01679 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01679 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01679 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01679 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01679 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01679 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01679 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01679 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
P01679 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01679 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01679 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01679 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01679 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01679 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01679 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01679 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01679 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms