Protein–RNA interactions for Protein: P00920

Ca2, Carbonic anhydrase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca2P00920 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca2P00920 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ca2P00920 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms