Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ccl20O89093 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ccl20O89093 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ccl20O89093 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ccl20O89093 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ccl20O89093 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ccl20O89093 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ccl20O89093 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ccl20O89093 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ccl20O89093 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ccl20O89093 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ccl20O89093 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ccl20O89093 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ccl20O89093 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Ccl20O89093 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ccl20O89093 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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