Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp1O89090 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sp1O89090 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp1O89090 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp1O89090 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sp1O89090 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms