Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopeO89079 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopeO89079 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopeO89079 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopeO89079 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopeO89079 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopeO89079 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopeO89079 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopeO89079 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CopeO89079 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CopeO89079 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopeO89079 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopeO89079 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopeO89079 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopeO89079 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopeO89079 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopeO89079 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopeO89079 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopeO89079 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopeO89079 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopeO89079 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopeO89079 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopeO89079 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopeO89079 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopeO89079 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CopeO89079 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopeO89079 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopeO89079 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopeO89079 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopeO89079 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopeO89079 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopeO89079 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopeO89079 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopeO89079 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopeO89079 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopeO89079 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopeO89079 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopeO89079 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopeO89079 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CopeO89079 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CopeO89079 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopeO89079 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopeO89079 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopeO89079 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopeO89079 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopeO89079 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopeO89079 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopeO89079 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopeO89079 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopeO89079 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopeO89079 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CopeO89079 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopeO89079 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopeO89079 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopeO89079 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopeO89079 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CopeO89079 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CopeO89079 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopeO89079 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopeO89079 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopeO89079 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopeO89079 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopeO89079 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopeO89079 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopeO89079 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CopeO89079 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms