Protein–RNA interactions for Protein: O88951

Lin7b, Protein lin-7 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin7bO88951 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lin7bO88951 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms