Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MscO88940 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MscO88940 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MscO88940 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MscO88940 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MscO88940 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MscO88940 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MscO88940 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MscO88940 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MscO88940 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MscO88940 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MscO88940 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MscO88940 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MscO88940 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MscO88940 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MscO88940 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MscO88940 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MscO88940 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MscO88940 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MscO88940 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MscO88940 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MscO88940 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MscO88940 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MscO88940 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MscO88940 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MscO88940 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MscO88940 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MscO88940 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MscO88940 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MscO88940 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MscO88940 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MscO88940 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MscO88940 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MscO88940 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MscO88940 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MscO88940 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MscO88940 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MscO88940 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MscO88940 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MscO88940 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MscO88940 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MscO88940 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MscO88940 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MscO88940 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MscO88940 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MscO88940 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MscO88940 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MscO88940 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MscO88940 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms