Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apaf1O88879 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Apaf1O88879 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms