Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JtbO88824 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JtbO88824 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JtbO88824 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JtbO88824 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JtbO88824 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JtbO88824 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JtbO88824 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
JtbO88824 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
JtbO88824 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JtbO88824 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JtbO88824 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JtbO88824 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
JtbO88824 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JtbO88824 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JtbO88824 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JtbO88824 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JtbO88824 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JtbO88824 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JtbO88824 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JtbO88824 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms