Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
F11rO88792 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
F11rO88792 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
F11rO88792 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
F11rO88792 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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F11rO88792 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
F11rO88792 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
F11rO88792 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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