Protein–RNA interactions for Protein: O88572

Lrp6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp6O88572 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrp6O88572 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrp6O88572 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp6O88572 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp6O88572 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrp6O88572 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms