Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dll3O88516 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dll3O88516 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Dll3O88516 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dll3O88516 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms