Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nid2O88322 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nid2O88322 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nid2O88322 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nid2O88322 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nid2O88322 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nid2O88322 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nid2O88322 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nid2O88322 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms