Protein–RNA interactions for Protein: O88199

Chst3, Carbohydrate sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst3O88199 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst3O88199 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
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Chst3O88199 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Chst3O88199 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Chst3O88199 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Chst3O88199 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Chst3O88199 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chst3O88199 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chst3O88199 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chst3O88199 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chst3O88199 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Chst3O88199 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chst3O88199 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chst3O88199 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chst3O88199 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chst3O88199 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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