Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtssO70370 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtssO70370 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtssO70370 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtssO70370 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CtssO70370 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
CtssO70370 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtssO70370 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtssO70370 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtssO70370 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtssO70370 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtssO70370 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtssO70370 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CtssO70370 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtssO70370 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtssO70370 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtssO70370 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtssO70370 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtssO70370 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtssO70370 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms