Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad51dO55230 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rad51dO55230 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms