Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlx3O55144 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlx3O55144 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms