Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nipsnap2O55126 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nipsnap2O55126 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms