Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nipsnap1O55125 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms