Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrxO55103 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrxO55103 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrxO55103 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrxO55103 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrxO55103 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrxO55103 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrxO55103 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrxO55103 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrxO55103 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrxO55103 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrxO55103 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrxO55103 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrxO55103 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrxO55103 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrxO55103 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrxO55103 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrxO55103 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PrxO55103 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrxO55103 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PrxO55103 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PrxO55103 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrxO55103 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrxO55103 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrxO55103 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrxO55103 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrxO55103 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrxO55103 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrxO55103 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrxO55103 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrxO55103 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrxO55103 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PrxO55103 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrxO55103 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrxO55103 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrxO55103 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrxO55103 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrxO55103 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrxO55103 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrxO55103 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrxO55103 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PrxO55103 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PrxO55103 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrxO55103 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrxO55103 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrxO55103 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrxO55103 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrxO55103 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrxO55103 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrxO55103 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrxO55103 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrxO55103 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrxO55103 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrxO55103 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrxO55103 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrxO55103 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrxO55103 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrxO55103 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PrxO55103 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PrxO55103 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrxO55103 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrxO55103 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrxO55103 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrxO55103 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PrxO55103 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PrxO55103 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrxO55103 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms