Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LatO54957 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LatO54957 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LatO54957 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LatO54957 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LatO54957 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LatO54957 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LatO54957 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LatO54957 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LatO54957 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LatO54957 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LatO54957 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LatO54957 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LatO54957 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LatO54957 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LatO54957 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LatO54957 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LatO54957 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LatO54957 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LatO54957 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LatO54957 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LatO54957 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LatO54957 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LatO54957 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LatO54957 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LatO54957 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LatO54957 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LatO54957 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms