Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole2O54956 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pole2O54956 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole2O54956 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pole2O54956 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms