Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema6bO54951 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms