Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EdaO54693 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EdaO54693 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EdaO54693 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EdaO54693 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EdaO54693 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EdaO54693 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EdaO54693 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EdaO54693 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EdaO54693 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EdaO54693 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms