Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nek2O35942 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek2O35942 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek2O35942 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nek2O35942 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms