Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctnnd2O35927 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ctnnd2O35927 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms