Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdk5r2O35926 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms