Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bnc1O35914 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bnc1O35914 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms