Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms