Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Socs1O35716 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Socs1O35716 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms