Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NudcO35685 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NudcO35685 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NudcO35685 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NudcO35685 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NudcO35685 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NudcO35685 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NudcO35685 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NudcO35685 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NudcO35685 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NudcO35685 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NudcO35685 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NudcO35685 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NudcO35685 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NudcO35685 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NudcO35685 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NudcO35685 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NudcO35685 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NudcO35685 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NudcO35685 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NudcO35685 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NudcO35685 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NudcO35685 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NudcO35685 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NudcO35685 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NudcO35685 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NudcO35685 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NudcO35685 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NudcO35685 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NudcO35685 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NudcO35685 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NudcO35685 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NudcO35685 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NudcO35685 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NudcO35685 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NudcO35685 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NudcO35685 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NudcO35685 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NudcO35685 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NudcO35685 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NudcO35685 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NudcO35685 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NudcO35685 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NudcO35685 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NudcO35685 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NudcO35685 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NudcO35685 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NudcO35685 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NudcO35685 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NudcO35685 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NudcO35685 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NudcO35685 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NudcO35685 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NudcO35685 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NudcO35685 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NudcO35685 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NudcO35685 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NudcO35685 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NudcO35685 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NudcO35685 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NudcO35685 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NudcO35685 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NudcO35685 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NudcO35685 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NudcO35685 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NudcO35685 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NudcO35685 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NudcO35685 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NudcO35685 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NudcO35685 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NudcO35685 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NudcO35685 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NudcO35685 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NudcO35685 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NudcO35685 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NudcO35685 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NudcO35685 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NudcO35685 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NudcO35685 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NudcO35685 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NudcO35685 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NudcO35685 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NudcO35685 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NudcO35685 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NudcO35685 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NudcO35685 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NudcO35685 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NudcO35685 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NudcO35685 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NudcO35685 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NudcO35685 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NudcO35685 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NudcO35685 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NudcO35685 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NudcO35685 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NudcO35685 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NudcO35685 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NudcO35685 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NudcO35685 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NudcO35685 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms