Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Opn1mwO35599 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1mwO35599 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms