Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xbp1O35426 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms