Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna3O35344 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms